O Conselho Gestor tem a função de garantir a participação ativa de todos os segmentos da AEN, promovendo a descentralização e a responsabilidade compartilhada. As decisões são tomadas coletivamente e visam contribuir para a atuação dos dirigentes escolares, assegurando tanto a qualidade do ensino quanto uma gestão democrática.

Além disso, o Conselho Gestor inclui responsáveis, professores, funcionários e diretores da escola, que exercem funções deliberativas, mediadoras, fiscalizadoras, mobilizadoras e pedagógicas.